中医药学作为中国传统文化的一个部分，在思想与政治急剧变革的时代，被当作旧传统、旧文化一并否定，当时最有影响的陈独秀、胡适、鲁迅、严复等都有这方面言论。

傅斯年是知识界反中医最激烈的。1934年他撰文说:“中国现在最可怕最可恨最可使人气短的事不是匪患，不是外患，而应是所谓西医中医之争

胡适口中，中医根本就“毫无学理，不足为法”。

俞樾是近代中国主张废除中医最早的人，他的观点是“医可废，药不可尽废”。

在余云岫的叙述中，虽然断定中医立足于阴阳五行的哲学式空想之上，但他认可了中医的实际疗效，他提出将理论与事实分离，从而摒弃中医理论，研究中医的药理，以科学的实验的药物学方法，对中医的处方做分析研究。

20世纪初，各大教会为了协调宣教事业，提出了“协和”理念，联合分布在不同区域的教派，具体表现为教育和医疗上的“协和”行动，教会、商业、医药，三位一体地大规模进入中国。他们集资合办医院和医科学校，“凡是有传教士的足迹，就有西式诊所和医院”。北京协和医学院就是这个理念的产物，1917年由美国洛克菲勒基金会出资创办。在所有教会医学院校中，北京协和医学院最为著名，到1936年，从协和毕业了166名医师和86名护士，其中很多人成为中国现代医学的中坚，同时也不可否认从肉体到精神上征服他者文化是教会的原初目的，这一目的使西医与中医相遇时，往往和政治局势、文化思潮、社会形态、民族认同和国家观念纠葛成错综复杂的

1568年澳门区主教卡内罗在澳门创办了中国境内的第一所西医教会医院，从此西医来华就未曾间断，但那时他们的主要活动只是在澳门、广州一带，而且大多是传教士医生，主要工作是传教，行医是接近民众获得良好印象的传教辅助方式。

虽然西医不尽善，但也还应该扶植西医。因为西医连同的科学是中国富强的方向。在胡适口中，中医根本就“毫无学理，不足为法”。

他基本秉承了俞樾《医药说》的观点。俞樾是近代中国主张废除中医最早的人，他的观点是“医可废，药不可尽废”。俞樾是清末著名的国学大师，他在治经之余，对中医药学也有所研究，且能处方治病

汉代名医张仲景的《伤寒杂病论》被认为是中医体系的确立之始，自隋朝开始，王朝都设太医院，而且由于典籍在儒生手中成为学问和修养的一部分，所以能成大体统一的局面。